Hubungan Jokowi dan Megawati memburuk karena Presiden ditengarai mendukung Prabowo-Gibran di Pilpres 2024. PDIP mengusung Ganjar Pranowo dan Mahfud Md. Serta sikap yang dianggap kurang etis kepada PDIP yang telah mendukungnya sebagai Presiden dan mendukung Gibran sebagai Walikota Solo.
Jokowi membantah ikut campur dalam penyusunan kabinet Prabowo. Eks Walikota Solo itu mengatakan formasi kabinet merupakan hak prerogatif presiden terpilih.
“Kabinet itu adalah 100 persen hak prerogatif presiden. Kalau usul-usul boleh, tapi itu hak penuh presiden terpilih,” kata Jokowi di Jakarta International Expo, Kemayoran, Jakarta Pusat, pada Jumat, 3 Mei 2024.